本书立足于制度逻辑的理论视角，以基础研究科研实践中的制度逻辑与创新行为互动关系诠释原始创新困境的本质。进而，通过制度环境变迁下的逻辑转换、制度逻辑对个体行为的形塑、个体能动的逻辑回应与选择等机制，揭示了行政逻辑、市场逻辑、专业逻辑之间的兼容与冲突关系，三重逻辑与科研个体行为的交互作用，及其对基础研究创新活动的负面影响。最后，基于上述层层递进的研究结果，对基础研究原创困境的形成机理做出了系统性解释。